Река Чебдар берет свое начало на восточном склоне Сумультинского хребта на границе Онгудайского и Улаганского районов Республики Алтай на высоте около 2500 метров. Чебдар почти на всем своем протяжении находится в ущелье, высота стен каньона которого местами доходит до 100 метров. На рельефной карте корошо видна глубина каньона реки (обведена красным цветом):
Сначала Чебдар течет с севера на юг между хребтов Сумультинский и Тонгош, ближе к середине постепенно поворачивает на восток.
Чебдар впадает в Башкаус в 10 километрах от устья Башкауса. В устье Чебдара есть дорога. Выше по Чебдару пройти проблематичено даже пешком. В устье хорошо видно, как изумрудно-зеленая вода Чебдара сливается с мутной водой Башкауса, долго не перемешиваясь. В устье над Чебдаром есть неплохая смотровая площадка, до которой подниматься вверх по склону 15-20 минут, переваливая высокую скальную гриву. С этой площадки открывается панорама ущелий Чебдара и Башкауса.
В месте впадения Чебдара в Башкаус хорошо ловиться хариус, в окрестностях много земляники и грибов.
От устья Чебдара есть тропа, которая сначала ведет по каньону Чебдара, а затем крутым серпантином поднимается в долину реки Чага, открывая панораму Чебдарского ущелья, долин рек Башкаус и Чулышман.
Устье Чебдара (справа)
Подавляющая часть ущелья реки Чебдар поросла лесами. Преобладающими породами здесь являются кедр и лиственница.
В Чебдар впадает масса мелких и несколько более крупных рек. Наиболее крупными притоками являются Уйкараташ, Тайтыйн, Сынырлу, Караган.
Очень важна оздоровительная роль, которую выполняют на Семинском перевале кедровые леса. Чистейший воздух, уникальный микроклимат дают хороший оздоровительный эффект